Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E4

Ttll2, Probable tubulin polyglutamylase TTLL2, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll2A4Q9E4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll2A4Q9E4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll2A4Q9E4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ttll2A4Q9E4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttll2A4Q9E4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttll2A4Q9E4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttll2A4Q9E4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttll2A4Q9E4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttll2A4Q9E4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttll2A4Q9E4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttll2A4Q9E4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttll2A4Q9E4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ttll2A4Q9E4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttll2A4Q9E4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms