Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pm20d2A3KG59 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms