Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Patl2A2ARM1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Patl2A2ARM1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms