Protein–RNA interactions for Protein: A2ARI4

Lgr4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr4A2ARI4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lgr4A2ARI4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lgr4A2ARI4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms