Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rtf1A2AQ19 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rtf1A2AQ19 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms