Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tubb1A2AQ07 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tubb1A2AQ07 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms