Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttll9A2APC3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms