Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pramef6A2A8M8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pramef6A2A8M8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms