Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIX9

Cfap99, Cilia and flagella-associated protein 99, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap99A0A140LIX9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap99A0A140LIX9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap99A0A140LIX9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap99A0A140LIX9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap99A0A140LIX9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cfap99A0A140LIX9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap99A0A140LIX9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap99A0A140LIX9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap99A0A140LIX9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap99A0A140LIX9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap99A0A140LIX9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
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