Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
A0A0U1RNP2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
A0A0U1RNP2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms