Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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