Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms