Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Plekhh2-201ENSMUST00000047206 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm36529-201ENSMUST00000222495 1529 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm26899-201ENSMUST00000181963 3328 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm44000-201ENSMUST00000205038 1478 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Tbata-207ENSMUST00000140456 953 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm17102-201ENSMUST00000170929 906 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm31374-202ENSMUST00000214913 914 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm18225-201ENSMUST00000216708 742 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Klra6-201ENSMUST00000074056 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Olfr583-201ENSMUST00000098211 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 AC121094.1-201ENSMUST00000224766 1345 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Vwde-201ENSMUST00000054530 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Spire1-201ENSMUST00000045105 5033 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Bmi1-202ENSMUST00000051929 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 AC154630.1-201ENSMUST00000215334 2440 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Trbv26-201ENSMUST00000103280 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm24790-201ENSMUST00000104285 132 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 BC080695-201ENSMUST00000105765 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Defb42-202ENSMUST00000111203 567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Olfr1171-ps1-201ENSMUST00000118079 837 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm11280-201ENSMUST00000124912 268 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm12971-201ENSMUST00000154720 511 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm31861-201ENSMUST00000204563 672 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm44787-202ENSMUST00000208339 1069 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Gm46192-201ENSMUST00000217894 326 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Olfr231-201ENSMUST00000063030 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Olfr652-201ENSMUST00000098175 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 Olfr570-201ENSMUST00000098215 1045 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Usp20Q8C6M1 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.5 ms