Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm44695-201ENSMUST00000205567 1631 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm43162-201ENSMUST00000198292 1770 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Map9-201ENSMUST00000091014 6218 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Mir331-201ENSMUST00000083673 96 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Olfr1336-202ENSMUST00000214301 6882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Ifi202b-201ENSMUST00000000266 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 BB365896-201ENSMUST00000173978 3000 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm43343-201ENSMUST00000202454 1926 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Nlrp9c-201ENSMUST00000041845 2631 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm43180-201ENSMUST00000197541 2886 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Mir680-1-201ENSMUST00000102257 109 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm12303-201ENSMUST00000119506 673 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Ctla2b-201ENSMUST00000021884 842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm35585-201ENSMUST00000195996 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Kcnma1-208ENSMUST00000177634 4605 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Nat2-201ENSMUST00000093470 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Olfr9-201ENSMUST00000091996 2672 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Unc13c-201ENSMUST00000075245 6633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Ppp1r1c-203ENSMUST00000111780 708 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r-ps95-201ENSMUST00000118641 903 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm7152-201ENSMUST00000163570 605 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm2429-201ENSMUST00000194635 586 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm34149-201ENSMUST00000203547 304 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Atg4aQ8C9S8 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms