Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Rabep1-207ENSMUST00000178245 2460 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Ube4a-201ENSMUST00000117506 6039 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Sntg1-204ENSMUST00000132064 4165 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Olfr704-202ENSMUST00000098141 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Sirpb1a-201ENSMUST00000099201 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Osbpl9-213ENSMUST00000160271 2604 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm37127-201ENSMUST00000192924 3036 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Oxr1-201ENSMUST00000022918 4232 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Slc6a14-201ENSMUST00000033414 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm43441-201ENSMUST00000201458 205 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm44213-201ENSMUST00000204977 703 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm45405-201ENSMUST00000211544 609 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Fbxw18-201ENSMUST00000098359 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc6D3YZP9 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Ctage5-209ENSMUST00000175912 2885 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Trmt10a-206ENSMUST00000162864 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Ect2-203ENSMUST00000108300 4086 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 AC156031.1-201ENSMUST00000217288 2555 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 9630002D21Rik-202ENSMUST00000222033 2345 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm10693-202ENSMUST00000205904 4007 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm24544-201ENSMUST00000103862 110 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm14587-201ENSMUST00000121714 658 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm27834-201ENSMUST00000183427 125 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc6D3YZP9 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms