Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Mier1-202ENSMUST00000097945 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm26300-201ENSMUST00000102282 94 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Junos-206ENSMUST00000133772 635 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm16079-201ENSMUST00000149065 578 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm21614-201ENSMUST00000183260 1005 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm29060-201ENSMUST00000185339 457 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm18700-201ENSMUST00000185791 553 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm28887-201ENSMUST00000186065 294 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm28664-201ENSMUST00000186118 457 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 2310020H05Rik-201ENSMUST00000189489 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Tmed10-203ENSMUST00000222585 619 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Nsa2-203ENSMUST00000225410 974 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm8444-201ENSMUST00000092020 357 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Olfr1120-202ENSMUST00000215163 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Slamf6-201ENSMUST00000171330 2485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm15400-201ENSMUST00000118944 601 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm15696-201ENSMUST00000121730 445 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm17191-201ENSMUST00000165200 417 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm43354-201ENSMUST00000196862 346 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CtcflA2APF3 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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