Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm21654-201ENSMUST00000188086 691 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm38185-201ENSMUST00000193195 694 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm43348-201ENSMUST00000197867 530 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm21461-201ENSMUST00000200382 863 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm31904-201ENSMUST00000219446 877 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 AC099934.5-201ENSMUST00000222699 945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Olfr111-201ENSMUST00000097325 1041 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm37551-201ENSMUST00000195556 2861 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Olfr31-202ENSMUST00000206009 4017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Dazl-201ENSMUST00000010736 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 P2ry12-203ENSMUST00000196583 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Ints6l-202ENSMUST00000101553 3201 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm37846-201ENSMUST00000191840 3774 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm43682-201ENSMUST00000202150 2090 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r101-201ENSMUST00000164245 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r119-201ENSMUST00000164683 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r149-201ENSMUST00000165916 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm24957-201ENSMUST00000179604 132 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm27653-201ENSMUST00000185037 136 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm29521-203ENSMUST00000216148 805 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Defa26-201ENSMUST00000074343 372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r13-201ENSMUST00000078885 903 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm4954-201ENSMUST00000135069 1601 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Pigb-201ENSMUST00000093819 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm39321-201ENSMUST00000216597 2075 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Gm42725-201ENSMUST00000199296 4193 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 AC132852.1-201ENSMUST00000214683 2324 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Cpne9Q1RLL3 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.7 ms