Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Cxcr1-202ENSMUST00000190313 1451 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Olfr965-203ENSMUST00000215164 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 AC122769.1-201ENSMUST00000226930 1714 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm38070-201ENSMUST00000191850 6480 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Trappc1-204ENSMUST00000108662 635 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Tpmt-202ENSMUST00000110118 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm16027-201ENSMUST00000161618 758 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm37203-201ENSMUST00000191618 385 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm31831-202ENSMUST00000198581 278 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Cd209d-202ENSMUST00000209176 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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Gm2056J3QQ02 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 AC119573.1-201ENSMUST00000227960 757 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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Gm2056J3QQ02 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Kcnrg-201ENSMUST00000051184 1766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Btbd3-201ENSMUST00000075410 4940 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Fbxw28-204ENSMUST00000200156 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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Gm2056J3QQ02 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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Gm2056J3QQ02 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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Gm2056J3QQ02 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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Gm2056J3QQ02 Ube2u-202ENSMUST00000133493 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Krtap9-5-201ENSMUST00000105052 1077 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Scimp-202ENSMUST00000108534 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Vmn1r175-201ENSMUST00000166141 915 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm2619-202ENSMUST00000166777 651 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm28122-201ENSMUST00000187088 615 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm29652-201ENSMUST00000188622 615 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm28819-206ENSMUST00000188816 615 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm29079-201ENSMUST00000188875 615 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm29382-201ENSMUST00000189549 615 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 Gm29212-201ENSMUST00000190384 615 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Gm2056J3QQ02 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
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