Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37249-201ENSMUST00000195185 2869 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gabpb1-201ENSMUST00000039978 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12438-201ENSMUST00000122034 336 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21748-201ENSMUST00000179623 309 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29409-202ENSMUST00000189623 901 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42464-202ENSMUST00000198111 774 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 AC153532.2-201ENSMUST00000219753 3844 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Glrx-202ENSMUST00000220523 493 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 AC163621.1-201ENSMUST00000220695 379 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 AC122357.3-201ENSMUST00000221260 2293 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr736-203ENSMUST00000213755 2338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Lrriq1-201ENSMUST00000020043 2542 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4011-201ENSMUST00000174657 2555 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 AC121942.1-201ENSMUST00000224459 2891 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 1700022I11Rik-201ENSMUST00000030163 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Trim6-201ENSMUST00000098180 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37482-201ENSMUST00000194899 2791 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17473-201ENSMUST00000180585 2216 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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