Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm28996-201ENSMUST00000190316 721 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Ighv1-10-201ENSMUST00000194372 355 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm37358-201ENSMUST00000195492 479 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Il6-204ENSMUST00000199765 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm43126-201ENSMUST00000201546 429 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm44993-201ENSMUST00000208435 842 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm45435-201ENSMUST00000211147 475 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 AC113305.1-201ENSMUST00000214664 724 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 AC130547.1-201ENSMUST00000228079 1047 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Tom1l1-202ENSMUST00000107867 2439 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm43900-201ENSMUST00000204868 2669 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm5930-201ENSMUST00000111863 1746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm10373-201ENSMUST00000100683 668 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Olfr616-201ENSMUST00000106886 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm15361-201ENSMUST00000119320 444 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Sult1b1-203ENSMUST00000120150 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 1700047A11Rik-201ENSMUST00000144750 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm2959-201ENSMUST00000169844 621 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Spin2-ps6-201ENSMUST00000178459 525 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm498-203ENSMUST00000179036 990 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Csf2-201ENSMUST00000019060 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Olfr1455-ps1-201ENSMUST00000208608 771 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 AC134439.2-201ENSMUST00000221950 467 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 AC132833.3-201ENSMUST00000227472 866 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Ube2dnl1-201ENSMUST00000059509 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Olfr1431-201ENSMUST00000072316 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm42892-201ENSMUST00000196227 3973 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm44750-201ENSMUST00000206185 2223 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Pde6aP27664 Fam26d-202ENSMUST00000218239 3075 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms