Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm45334-201ENSMUST00000211118 1227 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Lrrc72-203ENSMUST00000221155 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Vmn2r95-201ENSMUST00000166327 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 C230085N15Rik-201ENSMUST00000194893 4327 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm26691-202ENSMUST00000181952 4183 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Cntn1-201ENSMUST00000000109 5646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Slc22a29-205ENSMUST00000222533 1473 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Mbnl1-207ENSMUST00000192607 4552 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 A330049N07Rik-202ENSMUST00000219920 587 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm6563-201ENSMUST00000056396 869 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm6602-201ENSMUST00000198910 1927 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm11533-201ENSMUST00000120287 477 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm11415-201ENSMUST00000128214 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Vmn1r158-201ENSMUST00000174643 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Pkp1P97350 Nt5c3-202ENSMUST00000101367 1519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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