Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm29474-201ENSMUST00000187688 379 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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Ctdnep1Q3TP92 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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Ctdnep1Q3TP92 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Prl8a8-204ENSMUST00000224072 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Ctdnep1Q3TP92 Olfr1016-201ENSMUST00000099915 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Csde1-214ENSMUST00000199240 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Mctp1-205ENSMUST00000126960 1780 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Ctdnep1Q3TP92 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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Ctdnep1Q3TP92 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Ctdnep1Q3TP92 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Ctdnep1Q3TP92 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Ctdnep1Q3TP92 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Ctdnep1Q3TP92 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Ctdnep1Q3TP92 Ercc6l-201ENSMUST00000056904 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
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Ctdnep1Q3TP92 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm37092-201ENSMUST00000193381 1518 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Ctdnep1Q3TP92 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
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Ctdnep1Q3TP92 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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Ctdnep1Q3TP92 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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Ctdnep1Q3TP92 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 1700064J06Rik-201ENSMUST00000187551 386 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 A830029E22Rik-201ENSMUST00000193672 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Ctdnep1Q3TP92 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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