Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Olfr972-202ENSMUST00000215303 1641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Ptprd-218ENSMUST00000174180 5694 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm2539-201ENSMUST00000180720 2411 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Tmigd3-201ENSMUST00000010279 900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm15335-201ENSMUST00000122442 411 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm44432-201ENSMUST00000203342 938 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Cma2-202ENSMUST00000228263 857 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Olfr536-201ENSMUST00000064392 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Slco1a5-203ENSMUST00000111825 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Olfr191-202ENSMUST00000215647 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm23294-201ENSMUST00000104150 164 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm24363-201ENSMUST00000158440 311 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm8032-201ENSMUST00000171009 574 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Mir5125-201ENSMUST00000175240 79 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm31306-201ENSMUST00000197517 508 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm45596-201ENSMUST00000209279 434 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm45883-201ENSMUST00000210131 853 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AC124709.3-201ENSMUST00000227294 171 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Samt3-201ENSMUST00000047945 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r86-204ENSMUST00000227700 5487 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Cpne9Q1RLL3 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms