Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Olfr1106-203ENSMUST00000217650 2573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
P10404 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Vmn1r36-204ENSMUST00000226829 1923 ntAPPRIS P2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 4732465J04Rik-202ENSMUST00000187483 2744 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Dcp2-201ENSMUST00000025350 8616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm12740-201ENSMUST00000118794 308 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm7571-201ENSMUST00000120252 927 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm13471-201ENSMUST00000122057 433 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm14401-204ENSMUST00000134614 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm23392-201ENSMUST00000157580 113 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm5787-201ENSMUST00000183049 1038 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm28802-201ENSMUST00000188624 944 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm36935-201ENSMUST00000192526 292 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm18752-201ENSMUST00000192876 608 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm6213-201ENSMUST00000209966 638 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm45666-201ENSMUST00000211474 277 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 CT030182.4-201ENSMUST00000223647 645 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 AV026068-218ENSMUST00000223980 575 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Magea4-201ENSMUST00000048675 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Ghrl-201ENSMUST00000064993 527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm23407-201ENSMUST00000082538 91 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Olfr1424-201ENSMUST00000087830 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Gm30292-201ENSMUST00000194198 3000 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Zfp37-205ENSMUST00000221329 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Rc3h2-201ENSMUST00000100143 8799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
P10404 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
P10404 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms