Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r96-201ENSMUST00000165692 2343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ccdc6D3YZP9 CT025619.1-201ENSMUST00000214294 2331 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
Ccdc6D3YZP9 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm37914-201ENSMUST00000195317 2679 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm45819-201ENSMUST00000210940 1751 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm11498-201ENSMUST00000120660 949 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm26895-201ENSMUST00000181295 619 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm33952-201ENSMUST00000197795 408 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm8290-201ENSMUST00000218202 477 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 AC165273.1-201ENSMUST00000222780 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Akr1e1-202ENSMUST00000110691 3288 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Ssxb10-201ENSMUST00000103003 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm29638-201ENSMUST00000186106 371 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Olfr1246-201ENSMUST00000187990 1078 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm38263-201ENSMUST00000195879 3059 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm20559-202ENSMUST00000201831 2993 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm37254-201ENSMUST00000193542 3901 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Ccdc32-202ENSMUST00000110833 732 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm15158-201ENSMUST00000120577 570 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm25389-201ENSMUST00000157340 286 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm38108-201ENSMUST00000193891 399 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccdc6D3YZP9 AC103672.2-201ENSMUST00000228146 1687 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms