Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm26893-202ENSMUST00000180965 2079 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm26552-202ENSMUST00000180980 2079 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Ighv8-12-201ENSMUST00000103540 315 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Klra7-204ENSMUST00000112013 1104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm13493-201ENSMUST00000120318 493 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm11472-201ENSMUST00000121305 556 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 4930558N11Rik-203ENSMUST00000211456 1180 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 AC166352.1-201ENSMUST00000215483 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Olfr836-201ENSMUST00000074986 955 ntAPPRIS P2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1143-201ENSMUST00000090708 945 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 AC153494.1-201ENSMUST00000218664 3041 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Amy2a5-201ENSMUST00000098673 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Cse1l-210ENSMUST00000168599 2748 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm44242-201ENSMUST00000204212 2721 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 2310002F09Rik-202ENSMUST00000181551 2468 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm15765-201ENSMUST00000118407 910 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm11364-201ENSMUST00000137593 297 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm23631-201ENSMUST00000175291 123 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 9330159M07Rik-203ENSMUST00000181448 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm28616-201ENSMUST00000187344 441 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm37705-201ENSMUST00000195111 577 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm43803-202ENSMUST00000197765 580 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rprd1bQ9CSU0 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms