Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Copa-201ENSMUST00000027833 4351 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm14510-201ENSMUST00000116165 1092 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Olfr334-ps1-201ENSMUST00000121252 892 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm29007-201ENSMUST00000190633 679 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm17984-201ENSMUST00000205286 859 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Fbxw13-201ENSMUST00000061456 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 A430027C01Rik-201ENSMUST00000194599 1644 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Car5b-201ENSMUST00000033739 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 St18-208ENSMUST00000140079 5892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm26994-201ENSMUST00000182027 1571 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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Hoxd10P28359 AC091783.3-201ENSMUST00000223969 681 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Zscan4b-201ENSMUST00000168158 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Sp100-212ENSMUST00000153574 1653 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Ap2b1-202ENSMUST00000065692 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm38414-202ENSMUST00000211253 1405 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd10P28359 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms