Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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Col5a3Q9JLI2 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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Col5a3Q9JLI2 Ogdh-202ENSMUST00000081894 4114 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 F5-201ENSMUST00000086040 7430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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Col5a3Q9JLI2 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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Col5a3Q9JLI2 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 AC117570.1-201ENSMUST00000214015 1886 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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Col5a3Q9JLI2 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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Col5a3Q9JLI2 Gm18541-201ENSMUST00000215935 538 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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Col5a3Q9JLI2 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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Col5a3Q9JLI2 Mgat4a-205ENSMUST00000151952 7251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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Col5a3Q9JLI2 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r40-203ENSMUST00000227669 2540 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Ctnnd1-208ENSMUST00000111677 5789 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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Col5a3Q9JLI2 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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Col5a3Q9JLI2 Olfr1138-201ENSMUST00000099848 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Cep170-215ENSMUST00000195717 6967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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Col5a3Q9JLI2 Gm9968-201ENSMUST00000147504 2990 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Olfr770-202ENSMUST00000203887 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Scn11a-202ENSMUST00000215718 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm5594-201ENSMUST00000172712 1429 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Slc38a1-202ENSMUST00000088454 7059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Brca1-201ENSMUST00000017290 6572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Zfp965-202ENSMUST00000109042 1271 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
Col5a3Q9JLI2 Zfp973-202ENSMUST00000121956 1271 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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