Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm13380-201ENSMUST00000124322 718 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Dab2-209ENSMUST00000161040 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r-ps46-201ENSMUST00000173862 949 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Gm37756-201ENSMUST00000191834 942 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Gm13078-201ENSMUST00000078695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Sgip1-205ENSMUST00000106882 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Naip2-201ENSMUST00000067975 4709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Olfr616-202ENSMUST00000214806 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Qser1-201ENSMUST00000117237 8973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Trim12aQ99PQ1 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Gm25564-201ENSMUST00000104604 132 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Tmem27-201ENSMUST00000015545 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Gm17198-201ENSMUST00000171792 1154 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
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Trim12aQ99PQ1 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Gm7745-201ENSMUST00000182235 973 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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Trim12aQ99PQ1 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
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Trim12aQ99PQ1 AC154595.2-201ENSMUST00000225067 310 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Mcts1-201ENSMUST00000000365 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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Trim12aQ99PQ1 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Olfr10-202ENSMUST00000217290 2776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r9-202ENSMUST00000227399 6778 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Gm4787-201ENSMUST00000062182 2474 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim12aQ99PQ1 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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