Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm12844-201ENSMUST00000119463 582 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm12007-201ENSMUST00000120978 597 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm13162-201ENSMUST00000121481 454 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm24228-201ENSMUST00000158829 129 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm9017-201ENSMUST00000159613 676 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Csnk2b-209ENSMUST00000174779 632 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm20954-201ENSMUST00000189078 644 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm29033-201ENSMUST00000189114 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm29614-201ENSMUST00000189263 694 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm28751-201ENSMUST00000189287 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm29559-201ENSMUST00000189412 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm28272-201ENSMUST00000189512 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm28483-201ENSMUST00000189519 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm28123-201ENSMUST00000189725 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm28502-201ENSMUST00000189781 476 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm28368-201ENSMUST00000189804 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm29119-201ENSMUST00000189973 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm28716-201ENSMUST00000190217 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm29239-201ENSMUST00000190304 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm28531-201ENSMUST00000190529 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm28165-201ENSMUST00000190669 694 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm32347-201ENSMUST00000192944 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm37990-201ENSMUST00000195821 696 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Shisa5-207ENSMUST00000197483 534 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm43576-201ENSMUST00000197937 871 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm21040-201ENSMUST00000199493 1132 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 AL606472.1-201ENSMUST00000224628 275 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 1700129C05Rik-201ENSMUST00000022548 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 AC123917.1-201ENSMUST00000228063 1048 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Fxyd4-201ENSMUST00000005114 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm6093-202ENSMUST00000222963 2163 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Pigc-202ENSMUST00000111594 3290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Ephb2-202ENSMUST00000105845 10902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 B3gnt5-207ENSMUST00000164397 4872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Tcf24-201ENSMUST00000097824 2639 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Mir669g-201ENSMUST00000116809 123 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Clcn1Q64347 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms