Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Vmn1r9-201ENSMUST00000171186 1051 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Nts-201ENSMUST00000020040 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 AC091783.2-201ENSMUST00000224626 740 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Zfp773-202ENSMUST00000211240 4073 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Ncoa2-202ENSMUST00000068304 8006 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm28683-201ENSMUST00000187134 615 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
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Ccdc18Q640L5 Gm28835-203ENSMUST00000190062 615 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Pde1c-202ENSMUST00000114327 6821 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Lingo2-202ENSMUST00000098151 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm17654-201ENSMUST00000166110 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Psg21-202ENSMUST00000182128 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Vmn1r57-204ENSMUST00000228062 2365 ntAPPRIS P1 BASIC9.41□□□□□ -0.9
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Ccdc18Q640L5 Arhgap15-203ENSMUST00000112824 3118 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
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Ccdc18Q640L5 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Mdrl-201ENSMUST00000180483 1020 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
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Ccdc18Q640L5 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
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Ccdc18Q640L5 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
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Ccdc18Q640L5 Pdzph1-201ENSMUST00000025064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Ccdc18Q640L5 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
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Ccdc18Q640L5 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
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Ccdc18Q640L5 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
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Ccdc18Q640L5 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 4933411E02Rik-201ENSMUST00000216779 1030 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 LOC102637012-201ENSMUST00000217248 2562 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Zfp607a-202ENSMUST00000205534 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Yes1-202ENSMUST00000168707 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Ccdc18Q640L5 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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