Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Olfr137-201ENSMUST00000057394 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Zfp993-201ENSMUST00000070932 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Rpl35a-ps7-201ENSMUST00000080603 333 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm45424-201ENSMUST00000210575 3300 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Olfr1246-204ENSMUST00000217254 5411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 4933409F18Rik-202ENSMUST00000222026 1584 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Mcf2-201ENSMUST00000033478 3659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Rabgap1-203ENSMUST00000112920 4847 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Lgi1-206ENSMUST00000198045 1483 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Olfr99-202ENSMUST00000216328 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Trim71Q1PSW8 Gm18880-201ENSMUST00000223333 1541 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm2245-201ENSMUST00000160698 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm14382-201ENSMUST00000117374 437 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Apol7d-203ENSMUST00000126516 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm20069-201ENSMUST00000178938 545 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm28532-201ENSMUST00000190408 572 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm37774-201ENSMUST00000194401 245 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 4930519H02Rik-202ENSMUST00000198907 968 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm31211-201ENSMUST00000199170 253 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm44733-202ENSMUST00000209063 582 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 H60c-203ENSMUST00000216211 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm18863-201ENSMUST00000217004 1299 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm18899-201ENSMUST00000217663 546 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Asf1a-204ENSMUST00000219271 725 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 S100g-201ENSMUST00000038769 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm37248-201ENSMUST00000193576 3174 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm44440-201ENSMUST00000203139 2373 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm12308-201ENSMUST00000120440 389 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm14515-201ENSMUST00000121327 216 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm16135-201ENSMUST00000129470 568 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm11680-201ENSMUST00000146550 439 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm19124-201ENSMUST00000191041 832 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Trim71Q1PSW8 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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