Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn2r25W4VSP2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vmn2r25W4VSP2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms