Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Top3bQ9Z321 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Top3bQ9Z321 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top3bQ9Z321 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms