Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsc22d3Q9Z2S7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsc22d3Q9Z2S7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsc22d3Q9Z2S7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsc22d3Q9Z2S7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsc22d3Q9Z2S7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsc22d3Q9Z2S7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsc22d3Q9Z2S7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsc22d3Q9Z2S7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsc22d3Q9Z2S7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsc22d3Q9Z2S7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsc22d3Q9Z2S7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsc22d3Q9Z2S7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsc22d3Q9Z2S7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsc22d3Q9Z2S7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsc22d3Q9Z2S7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsc22d3Q9Z2S7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms