Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubl3Q9Z2M6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubl3Q9Z2M6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms