Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cacna2d3Q9Z1L5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cacna2d3Q9Z1L5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms