Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NfkbiaQ9Z1E3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms