Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dctn3Q9Z0Y1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dctn3Q9Z0Y1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dctn3Q9Z0Y1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dctn3Q9Z0Y1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dctn3Q9Z0Y1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dctn3Q9Z0Y1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dctn3Q9Z0Y1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dctn3Q9Z0Y1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dctn3Q9Z0Y1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dctn3Q9Z0Y1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dctn3Q9Z0Y1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dctn3Q9Z0Y1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Dctn3Q9Z0Y1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dctn3Q9Z0Y1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dctn3Q9Z0Y1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dctn3Q9Z0Y1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dctn3Q9Z0Y1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dctn3Q9Z0Y1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dctn3Q9Z0Y1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dctn3Q9Z0Y1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dctn3Q9Z0Y1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dctn3Q9Z0Y1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dctn3Q9Z0Y1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dctn3Q9Z0Y1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dctn3Q9Z0Y1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dctn3Q9Z0Y1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dctn3Q9Z0Y1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dctn3Q9Z0Y1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dctn3Q9Z0Y1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dctn3Q9Z0Y1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dctn3Q9Z0Y1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms