Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Itgb6Q9Z0T9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb6Q9Z0T9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms