Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap4s1Q9WVL1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap4s1Q9WVL1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap4s1Q9WVL1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap4s1Q9WVL1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap4s1Q9WVL1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ap4s1Q9WVL1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms