Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF7

Pole, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 2,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PoleQ9WVF7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PoleQ9WVF7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PoleQ9WVF7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PoleQ9WVF7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PoleQ9WVF7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PoleQ9WVF7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PoleQ9WVF7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PoleQ9WVF7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PoleQ9WVF7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PoleQ9WVF7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PoleQ9WVF7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PoleQ9WVF7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PoleQ9WVF7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms