Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec2Q9WV35 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms