Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atp1a4Q9WV27 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atp1a4Q9WV27 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms