Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Stub1Q9WUD1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Stub1Q9WUD1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms