Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nfe2l3Q9WTM4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nfe2l3Q9WTM4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms