Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trex2Q9R1A9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trex2Q9R1A9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms