Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf4Q9QZS2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf4Q9QZS2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms