Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ChmlQ9QZD5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms