Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX96

Sall2, Sal-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall2Q9QX96 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sall2Q9QX96 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sall2Q9QX96 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms